Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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