Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms