Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp19Q3UJD6 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms