Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms