Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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