Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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PdgfraP26618 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PdgfraP26618 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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