Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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