Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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