Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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