Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccdc180J3QNE4 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccdc180J3QNE4 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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