Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp9yF8VPU6 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms