Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.5 ms