Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms