Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smg9Q9DB90 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms