Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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