Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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