Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms