Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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