Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rpusd3Q14AI6 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rpusd3Q14AI6 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rpusd3Q14AI6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rpusd3Q14AI6 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rpusd3Q14AI6 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rpusd3Q14AI6 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd3Q14AI6 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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