Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms