Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms