Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms