Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms