Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms