Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P10404 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms