Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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