Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms