Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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