Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ScaperF8VQ70 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ScaperF8VQ70 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
ScaperF8VQ70 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ScaperF8VQ70 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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