Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc6D3YZP9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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