Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usf3B2RUQ2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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