Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms