Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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