Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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