Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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