Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Trim12aQ99PQ1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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