Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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