Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms