Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Kdm4dQ3U2K5 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms