Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms