Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms