Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Sh3bp1P55194 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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