Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms