Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ggta1P23336 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ggta1P23336 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ggta1P23336 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ggta1P23336 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ggta1P23336 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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