Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P20040 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P20040 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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