Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms