Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc180J3QNE4 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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