Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms