Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms