Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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